Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, Petrozavodsk, Rusia
Aleksey N. Parshukov, Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, strada Pushkinskaya 11, Petrozavodsk 185910, Rusia.
Mikhail M. Solovyev, Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană a Academiei de Științe din Rusia, strada Frunze 11, Novosibirsk 630091, Rusia.
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Laborator pentru cercetare genomică și biotehnologie, Centrul de Științe Krasnoyarsk al Filialei Siberiene a Academiei Ruse de Științe, Krasnoyarsk, Rusia
LLC „FishForel”, Lahdenpohja, Karelia, Rusia
Institutul Papanin pentru Biologia Apelor Interioare, Academia Rusă de Științe, Borok, Rusia
IRTA-SCR, San Carlos de la Rapita, Tarragona, Spania
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Universitatea de Stat din Tomsk, Tomsk, Rusia
Aleksey N. Parshukov, Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, strada Pushkinskaya 11, Petrozavodsk 185910, Rusia.
Mikhail M. Solovyev, Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană a Academiei de Științe din Rusia, strada Frunze 11, Novosibirsk 630091, Rusia.
Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, Petrozavodsk, Rusia
Aleksey N. Parshukov, Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, strada Pushkinskaya 11, Petrozavodsk 185910, Rusia.
Mikhail M. Solovyev, Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană a Academiei de Științe din Rusia, strada Frunze 11, Novosibirsk 630091, Rusia.
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Laborator pentru cercetare genomică și biotehnologie, Centrul de Științe Krasnoyarsk al Filialei Siberiene a Academiei Ruse de Științe, Krasnoyarsk, Rusia
LLC „FishForel”, Lahdenpohja, Karelia, Rusia
Institutul Papanin pentru Biologia Apelor Interioare, Academia Rusă de Științe, Borok, Rusia
IRTA-SCR, San Carlos de la Rapita, Tarragona, Spania
Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană, Academia Rusă de Științe, Novosibirsk, Rusia
Universitatea de Stat din Tomsk, Tomsk, Rusia
Aleksey N. Parshukov, Institutul de Biologie al Centrului de Cercetare Karelian al Academiei de Științe din Rusia, strada Pushkinskaya 11, Petrozavodsk 185910, Rusia.
Mikhail M. Solovyev, Institutul de sistematică și ecologie a animalelor, filiala siberiană a Academiei de Științe din Rusia, strada Frunze 11, Novosibirsk 630091, Rusia.
Abstract
Scopul prezentului studiu a fost de a investiga compoziția microbiotei intestinale în timpul stadiului acut al unei infecții bacteriene pentru a înțelege modul în care disbioza intestinului poate influența ierarhia și diversitatea taxonomică generală și a determina dacă există un taxon bacterian servesc drept markeri pentru păstrăvul curcubeu sănătos sau bolnav (Oncorhynchus mykiss).
Metode și rezultate
Din iulie până în septembrie 2015, 29 de exemplare de 3 ani (o greutate medie de la 240 · 9 ± 37 · 7 la 850 · 7 ± 70 · 1 g) păstrăv curcubeu O. mykiss au fost studiate. Secvențierea de generație viitoare a genului ARN ribozomal 16S a fost aplicată pe probe de stomac și intestinale pentru a compara impactul stării infecției asupra microbiotei păstrăvului curcubeu O. mykiss (Walbaum) din partea de nord-vest a Eurasiei (regiunea Kareliană, Rusia). Diversitatea alfa (indicele Chao1, Simpson și Shannon) al comunității microbiene de păstrăv curcubeu sănătos a fost semnificativ mai mare decât la peștii nesănătoși. Cea mai mare contribuție la compoziția microbiană intestinală a peștilor sănătoși a fost adusă de apartenența la OTU Bacil, Serratia, Pseudomonas, Cetobacterium și Lactobacillus. Microbiota peștilor nesănătoși în majoritatea cazurilor a fost reprezentată de genuri Serratia, Bacillus și Pseudomonas. În microbiota peștilor nesănătoși au fost, de asemenea, înregistrați taxoni unici, cum ar fi bacteriile din familia Mycoplasmataceae și Renibacterium. Analiza testului de similitudini a relevat diferența semnificativă între microbiota stomacului și a intestinului (P ≤ 0 · 05).
Concluzii
O constatare substanțială a fost absența diferențelor între comunitățile microbiene ale stomacului și intestinului în grupurile nesănătoase, în comparație cu peștii sănătoși.
Semnificația și impactul studiului
Aceste rezultate au demonstrat modificări ale microbiotei intestinale a păstrăvului curcubeu cultivat, O. mykiss în timpul co-infecțiilor și poate fi util pentru dezvoltarea de noi strategii pentru programele de combatere a bolilor.
Numărul de ori citat conform CrossRef: 5
- Yang Wang, Qingkui Wang, Kezhi Xing, Pu Jiang, Jingru Wang, cinamaldehida dietetică și Bacillus subtilis îmbunătățesc performanța de creștere, activitatea enzimei digestive și capacitatea antioxidantă și formează microbiota intestinală în talpa limbii, Cynoglossus semilaevis, Acvacultură, 10.1016/j.aquacultura. 2020.735798, 531, (735798), (2021).
| jam14302-sup-0001-FileS1.epsimage/eps, 5,7 MB | FileS1. Variabilitatea individuală în stomac și intestin a filelor bacteriene la grupele de pești studiate. |
| jam14302-sup-0002-FileS2.epsimage/eps, 5,9 MB | FileS2. Variabilitatea individuală în stomac și intestin a familiilor bacteriene din grupele de pești studiați. |
| jam14302-sup-0003-FileS3.epsimage/eps, 5,8 MB | FișierS3. Variabilitatea individuală a bacteriilor din stomac și intestin la grupele de pești studiate la cel mai scăzut nivel taxonomic. |
| jam14302-sup-0004-FileS4.epsimage/eps, 956,4 KB | FișierS4. Filul stomacului cu cianobacterii |
Vă rugăm să rețineți: editorul nu este responsabil pentru conținutul sau funcționalitatea oricăror informații de susținere furnizate de autori. Orice întrebări (altele decât conținutul lipsă) ar trebui să fie adresate autorului corespunzător pentru articol.