Profesor Asociat

260 Diggs, Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară, 3640 Col. Glenn Hwy, Dayton, OH 45435

paliy

e-mail:

Educaţie:

B.Sc. + M.Sc.: Universitatea de Stat Lviv, Lviv, Ucraina. Genetica microbiană și ingineria genetică.

Doctorat: Universitatea din Manchester, Manchester, Marea Britanie. Biologie moleculară și structurală microbiană.

Postdoctoral: Universitatea din California la Berkeley, Berkeley, CA, SUA. Biologia sistemelor microbiene.

Domenii de interes de cercetare

Metodologii utilizate

Rolul microbilor intestinali în sănătatea umană și în bolile gastro-intestinale, cum ar fi IBS, diabetul și obezitatea

Interacțiuni metabolice în comunități microbiene complexe

Interacțiuni gazdă-microbiene ale enterobacteriilor patogene și comensale

Utilizarea modelării metabolice și matematice pentru a studia principiile biologice

Tehnici standard de microbiologie

Metode standard de biologie moleculară

Profilarea expresiei genelor cu microarrays și qPCR

Analiza comunității microbiene prin secvențializare de mare viteză, microarrays filogenetice și FISH

Bioinformatică și biologie computațională

Biostatistică și analiză filogenetică

Facilitate de secvențializare de mare viteză: faceți clic aici pentru detalii

Știri recente

Lucrare colaborativă publicată:

S. Pérez-Burillo, S. Rajakaruna, O. Paliy, S. Pastoriza și J.Á. Rufián-Henares. Bioactivitatea melanoidinelor alimentare este mediată de microbiota intestinală (2020) Food Chem., 316: 126309.

Lucrare colaborativă publicată:

M.P. Craig, S. Rajakaruna, O. Paliy, M. Sajjad, S. Madhavan, N. Reddy, J. Zhang, M. Bottomley, S. Agrawal, M.P. Kadakia. Semnături diferențiale de microARN în patogeneza esofagului Barrett (2020) Clin. Trad. Gastroenterol., 11 (1): e00125.

Lucrare publicată:

R.T. Agans, A. Gordon, S. Hussain și O. Paliy. Nanoparticulele de dioxid de titan provoacă un efect inhibitor direct mai mic asupra microbiotei intestinului uman decât nanoparticulele de argint (2019) Toxicol. Știință., 172 (2): 411-416.

  • Acest articol a fost ales pentru secțiunea Tox Spotlight.

Lucrare colaborativă publicată:

S. Rajakaruna, D.A. Freedman, A.R. Sehgal, X. Bui și O. Paliy. Calitatea dietei și indicii de masă corporală prezintă asocieri opuse cu microbiota intestinală distală într-o cohortă cu venituri mici (2019) J. Food Science. Tehnologie., 4 (7): 846-851.

Lucrare colaborativă publicată:

S. Pérez-Burillo, T. Mehta, S. Pastoriza, D.L. Kramer, O. Paliy și J.Á. Rufián-Henares. Potențialul salam probiotic cu fibre alimentare modulează capacitatea antioxidantă, producția de acizi grași cu lanț scurt și structura comunității microbiote intestinale (2019) Științe alimentare. Tehnologie., 105: 355-362.

Premiul studentului:

Jennifer Cano, o studentă talentată, a primit un grant de la Programul Louis Stokes Alliances for Minority Participation pentru 2019 să efectueze cercetări în laborator.

Lucrare colaborativă publicată:

S. Pérez-Burillo, T. Mehta, A. Esteban-Muñoz, S. Pastoriza, O. Paliy și J.Á. Rufián-Henares. Efectul digestiei-fermentației in vitro asupra bioactivității cafelei verzi și prăjite: rolul microbiotei intestinale (2019) Food Chem., 279: 252-259.

Lucrare publicată:

R. Agans, A. Gordon, D.L. Kramer, S. Pérez-Burillo, J.A. Rufián-Henares și O. Paliy. Acizii grași alimentari susțin creșterea microbiotei intestinului uman (2018) Aplic. Mediu Microbiol., 84 (21): e01525-18.

  • Acest articol a fost ales pentru reflectorul și comunicatul de presă AEM și pentru comunicatul de presă Wright State BSoM.

Lucrare colaborativă publicată:

E. Labib, M. Blaut, L. Hussein, M. Gouda, D.L. Kramer, O. Paliy, B. Ganesh, P. Schumann, R. Pukall, A. Woting și M.T. Fouad. Diversitatea moleculară a microbiotei intestinale și a acizilor grași cu lanț scurt la adulții egipteni în urma intervenției dietetice cu sobya fermentată (2018) J. Microbiol alimentar. Saf. Hyg., 3: 139.

Lucrare colaborativă publicată:

E. Kim, M. Lambert, G. Fallata, J. Rowe, T. Martin, A. Satoskar, N. Reo, O. Paliy, E. Cormet-Boyaka și P.N. Boyaka. Celulele epiteliale intestinale reglează răspunsurile intestinale CCL11 și severitatea alergiei (2018) Față. Immunol., 8: 10069.

Lucrare colaborativă publicată:

S. Sakaram, M. Craig, N. Hill, A. Aljagthmi, C. Garrido, O. Paliy, M. Bottomley, M.L. Raymer și M. Kadakia. Identificarea de noi miARN-uri reglementate de pNp63α utilizând o conductă optimizată de analiză RNA-Seq mică (2018) Știință. reprezentant., 8: 10069.

Lucrare colaborativă publicată:

M.C. Jugan, A.J. Rudinsky, A. Gordon, D.L. Kramer, J.B. Daniels, O. Paliy, P. Boyaka și C. Gilor. Efectele suplimentării orale de Akkermansia muciniphila la câinii sănătoși după administrarea antimicrobiană (2018) A.m. J. Veterinar. Rez., 79 (8): 884-892.

Lucrare publicată:

V. Shankar, R. Agans și O. Paliy. Avantajele analizelor de ordonare constrânsă bazate pe distanță filogenetică pentru examinarea comunităților microbiene (2017) Știință. reprezentant., 7 (1): 6481.

Lucrare publicată:

V. Shankar, M. Gouda, J. Moncivaiz, A. Gordon, N.V. Reo, L. Hussein și O. Paliy. Diferențele dintre metaboliții intestinali și compoziția și funcțiile microbiene dintre adolescenții egipteni și americani sunt în concordanță cu dietele consumate (2017) mSystems, 2 (1): e00169-16.

Studentul a recunoscut:

Alex Gordon, un doctorand talentat în laborator, a câștigat Premiul pentru prezentarea posterului pentru cel mai bun student absolvent la ședința OBASM 2016.

Recenzie invitată publicată:

O. Paliy și V. Shankar. Aplicarea tehnicilor statistice multivariate în ecologia microbiană (2016) Mol. Ecol., 25 (5): 1032-57.

Lucrare publicată:

V. Shankar, N.V. Reo și O. Paliy. Profilarea simultană microbiană și metabolită fecală permite clasificarea precisă a sindromului de colon iritabil pediatric (2015) Microbiom, 3: 73.

Studenții prezintă postere:

R. Agans, L. Rigsbee, O. Paliy. Microbiota intestinală umană este eficientă în utilizarea grăsimilor dietetice pentru creștere, așa cum este demonstrat de întreținerea pe termen lung a comunității în simulatorul intestinului. Simpozionul Microbiome, Ann Arbor, MI, 2015.

V. Shankar, D. Homer, L. Rigsbee, M. Raymer, N. V. Reo, O. Paliy. Interogarea simultană a metaboliților și microbilor fecali relevă diferențe în rețeaua de asociații intestinale microb-metaboliți între sănătate și sindromul intestinului iritabil. Simpozionul Microbiome, Ann Arbor, MI, 2015.

Studentul primește premiul de bursă:

Richard Agans și Dr. Oleg Paliy a fost distins cu DAGSI/AFRL Bursă student-facultate din Ohio adjudecare. Titlul proiectului este „Interacțiunea biomoleculară a nanoparticulelor și a altor substanțe chimice aerospațiale cu profiluri microbiene și metabolite intestinale”.

Acordarea de burse studențești:

Alex Gordon, un student absolvent talentat în laborator, a primit un Grantul original pentru muncă de la Adunarea Studenților Absolvenți WSU pentru anul 2015.

Lucrare publicată:

V. Shankar, D. Homer, L. Rigsbee, H.J. Khamis, S. Michail, M. Raymer, N.V. Reo și O. Paliy. Rețelele de asociații ale microbilor-metaboliți ai intestinului uman sunt diferite între sănătate și sindromul intestinului iritabil (2015) ISME J., 9 (8): 1899-903.

Student prezintă afiș:

V. Shankar, D. Homer, L. Rigsbee, H. J. Khamis, M. Raymer, N. V. Reo, O. Paliy. Interogarea simultană a metaboliților și microbilor fecali relevă diferențe în rețeaua de asociații intestinale microb-metaboliți între sănătate și sindromul intestinului iritabil. ASM Beneficial Microbes Conferința internațională a cincea, Washington, DC, 2014.

Studentul a recunoscut:

Vijay Shankar, un talentat doctorand în laborator, a câștigat Premiul pentru prezentarea posterului pentru cel mai bun student absolvent la ședința OBASM 2014.

Finanțare actuală și anterioară

UWM RGI [2017-2020] „Înțelegerea și îmbunătățirea interacțiunilor rizob-cereale”

DARPA/Ginkgo Bioworks [2016-2018] „Construcții inginerești CRISPR pentru a modula compoziția comunității microbiene”

AHA GiA [2016-2019] „Efectele protectoare ale acizilor grași cu lanț scurt împotriva endocarditei infecțioase”

NIH NIDDK R01 [2015-2020] "Reglarea celulelor epiteliale intestinale a inflamației alergice în locuri îndepărtate"

Bursa NSF pentru instrumente majore de cercetare [2015-2018] „Achiziționarea unui cluster de calculatoare de înaltă performanță pentru cercetare și educație computațională multidisciplinară”

DAGSI/Laboratorul de Cercetare a Forțelor Aeriene [2015-2018] „Interacțiunea biomoleculară a nanoparticulelor și a altor substanțe chimice aerospațiale cu profiluri microbiene și metabolite intestinale”

Bursa NSF pentru instrumente majore de cercetare [2013-2016] „Înființarea unei instalații de secvențiere de generație următoare la WSU”

WSU BSoM Emerging Science Program [2013-2014] „Microbiota intestinală la copiii din lumea în curs de dezvoltare”

Grantul de cercetare Procter & Gamble [2011-2016] „Studii asupra microbiotei intestinului uman”

WSU BSoM Research Challenge [2011-2012] "Detecția cu randament ridicat a diferențelor cantitative în microbiota intestinală la pacienții cu cancer colorectal și polipi adenomatoși avansați"

NIH NICHD [2010-2013] „Măsurători cantitative ale metaboliților intestinali la copii sănătoși și IBS”

Grantul de cercetare Procter & Gamble [2010-2011] „Extracția ADN-ului din material fecal”

NIH NCCAM [2008-2011] „Utilizarea matricei de microflora Affymetrix pentru a studia compoziția microflorei la copiii cu IBS”