Caracterizarea profilurilor mici de expresie a ARN necodificator (sncRNA) în liniile celulare de cancer mamar triple-negativ (TNBC). (A) Grafic de bare care arată numărul de microARN-uri exprimate (miARN-uri), ARN de transfer (ARNt-uri), ARN-uri nucleolare mici (snoARN-uri), ARN-uri nucleare mici (snARN-uri), ARN-interacțiune PIWI (piARN-uri) și alte ARN-uri mici necodificate (sncARN-uri) )) în liniile celulare indicate. Sunt raportate numai sncRNA-uri al căror nivel de expresie a depășit trei citiri normalizate. (B) Diagrama Venn care arată numărul de miARN comune și specifice, foarte exprimate (nivel de expresie peste al treilea quartil al numărului de citiri normalizate) în liniile celulare TNBC.

Expresia mARN a receptorilor de estrogen beta (ERβ) și supraviețuirea pacienților cu cancer mamar din cohorta The Cancer Genome Atlas (TCGA) [25]. Curbele Kaplan-Meier ale supraviețuirii globale pentru pacienții cu cancer de sân (BC) (A) și TNBC (B) în ceea ce privește nivelul de expresie al ARNm ERβ (expresie scăzută: valori sub primul quartile, expresie ridicată: valori peste al treilea quartile). Zona evidențiată indică intervalul de încredere.

Schimbarea indusă de ERβ a profilului sncRNA în țesuturile TNBC și efectul său putativ asupra proceselor moleculare. (A) Histogramă care arată numărul de miARN, tARN, snoARN, snARN, piARN și alți sncARN detectați în probele de țesut ERβ- și ERβ +. Sunt raportate doar sncARN-urile al căror nivel de expresie median a depășit un prag minim (trei citiri normalizate). (B) Heatmaps care arată miARN (stânga) și alte sncARN (dreapta) dereglate în țesuturile ERβ + TNBC (| FC | ≥ 1,3, p C) și în primele 20 de căi de semnalizare semnificative statistic (D), identificate prin IPA efectuate pe gene exprimate în țesuturile TNBC și se prezice a fi ținte ale miARN-urilor în mod obișnuit dereglate atât în ​​țesuturi, cât și în cel puțin două dintre liniile celulare studiate.

Efect putativ al dereglării miR-181a-5p asupra proceselor moleculare din țesuturile TNBC. Reprezentarea grafică a funcțiilor biologice semnificative statistic (A) și a primelor 20 de căi de semnalizare statistic semnificative (B), așa cum au fost identificate de IPA efectuate pe un grup de gene exprimate în țesuturile TNBC și prezise a fi ținte ale miR-181a-5p. (C) Reprezentarea schematică a genelor care participă la biosinteza colesterolului care au fost găsite anterior reglate în jos de ERβ în celulele TNBC [15], cu ținte miR-181a-5p prezentate în roșu.

Abstract

arn-urilor

Caracterizarea profilurilor mici de expresie a ARN necodificator (sncRNA) în liniile celulare de cancer mamar triple-negativ (TNBC). (A) Grafic de bare care arată numărul de microARN-uri exprimate (miARN-uri), ARN de transfer (ARNt-uri), ARN-uri nucleolare mici (snoARN-uri), ARN-uri nucleare mici (snARN-uri), ARN-interacțiune PIWI (piARN-uri) și alte ARN-uri mici necodificate (sncARN-uri) )) în liniile celulare indicate. Sunt raportate numai sncRNA-uri al căror nivel de expresie a depășit trei citiri normalizate. (B) Diagrama Venn care arată numărul de miARN comune și specifice, foarte exprimate (nivel de expresie peste al treilea quartil al numărului de citiri normalizate) în liniile celulare TNBC.

Expresia ARNm a receptorilor de estrogen beta (ERβ) și supraviețuirea pacienților cu cancer mamar din cohorta Cancer Genome Atlas (TCGA) [25]. Curbele Kaplan-Meier ale supraviețuirii globale pentru pacienții cu cancer de sân (BC) (A) și TNBC (B) în ceea ce privește nivelul de expresie al ARNm ERβ (expresie scăzută: valori sub primul quartile, expresie ridicată: valori peste al treilea quartile). Zona evidențiată indică intervalul de încredere.

Schimbarea indusă de ERβ a profilului sncRNA în țesuturile TNBC și efectul său putativ asupra proceselor moleculare. (A) Histogramă care arată numărul de miARN, tARN, snoARN, snARN, piARN și alți sncARN detectați în probele de țesut ERβ- și ERβ +. Sunt raportate doar sncARN-urile al căror nivel de expresie median a depășit un prag minim (trei citiri normalizate). (B) Heatmaps care arată miARN (stânga) și alte sncARN (dreapta) dereglate în țesuturile ERβ + TNBC (| FC | ≥ 1,3, p C) și în primele 20 de căi de semnalizare semnificative statistic (D), identificate prin IPA efectuate pe gene exprimate în țesuturile TNBC și se prezice a fi ținte ale miARN-urilor în mod obișnuit dereglate atât în ​​țesuturi, cât și în cel puțin două dintre liniile celulare studiate.

Efect putativ al dereglării miR-181a-5p asupra proceselor moleculare din țesuturile TNBC. Reprezentarea grafică a funcțiilor biologice semnificative statistic (A) și a primelor 20 de căi de semnalizare statistic semnificative (B), așa cum au fost identificate de IPA efectuate pe un grup de gene exprimate în țesuturile TNBC și prezise a fi ținte ale miR-181a-5p. (C) Reprezentarea schematică a genelor care participă la biosinteza colesterolului care au fost găsite anterior reglate în jos de ERβ în celulele TNBC [15], cu ținte miR-181a-5p prezentate în roșu.