Diagrama Venn a miARN-urilor de afine din bibliotecile de fructe albe (WF) și albastre (BF).

analiza

Analiza filogenetică a secvențelor mature de miARN cunoscute de afine (Vaccinium corymbosum) și struguri (Vitis vinifera) obținute din datele de secvențiere (această lucrare) și respectiv miRbase 21.0. MiARN-urile au fost grupate în 10 clase (I - X). MiARN-urile cu fundal albastru deschis provin din afine, iar cele în gri închis provin din struguri din inelul interior. Inelul din mijloc arată familiile de miARN în diferite culori. Inelul exterior arată lungimea miARN-urilor mature.

Analiza expresiei miARN-urilor cunoscute și noi din afine obținute din datele de secvențiere. miARN-urile au fost grupate în 3 clase (I - III) pe baza modelelor lor de acumulare. WF și BF se referă la fructele albe și respectiv fructele albastre.

Compararea expresiei miARN-urilor selectate între etapele WF și BF în afine prin qRT-PCR și secvențierea profundă. Linia gri reprezintă modificările calculate din abundența transcrierii. Bara verde indică nivelul de expresie relativ determinat de analiza qRT-PCR. Eroarea standard a mediei este reprezentată de o bară de eroare. WF și BF se referă la fructele albe și respectiv fructele albastre.

Clasificarea ontologiei genelor genelor țintă pentru miARN cunoscute exprimate diferențial între bibliotecile de stadiul fructelor albe și stadiile fructelor mature în afine.

Un model schematic care prezintă rolurile propuse ale miARN-urilor implicate în dezvoltarea și maturarea fructelor de afine. Bara și săgeata T se referă la efectul negativ și pozitiv asupra efectorului din aval sau respectiv asupra procesului biologic.