Abstract

O abordare utilizată pentru investigarea compoziției lipidice a lipidelor lipite de ADN de fracțiune 1 (fracțiunea 1) și strâns (fracțiunea 2) Pseudomonas aurantiaca celulele prin ionizare prin electrospray utilizând spectrometria de masă (ESI-LC-MS) au fost utilizate pentru a determina lipidomul unei celule procariote. S-au detectat acizi grași liberi C16: 0, C18: 1 (fracția 1), C14: 0, C16: 0 și C18: 2 (fracția 2). Ambele fracții de lipide legate de ADN au fost caracterizate prin prezența fosfatidilglicerolului, fosfatidilserinei și lizofosfatidilinozitolului. Fracția 1 solubilă în alcool ar putea conține, de asemenea, fosfatidilcolină și fosfatidilinozitol, în timp ce fracția 2 conține probabil triacilgliceride. Comparativ cu cromatografia gazoasă, ESI-LC-MS oferă noi posibilități de investigare a lipidomului nucleoid, permițând o investigație mai detaliată a lipidelor legate de ADN din celulele bacteriene.

profilurile

Aceasta este o previzualizare a conținutului abonamentului, conectați-vă pentru a verifica accesul.

Opțiuni de acces

Cumpărați un singur articol

Acces instant la PDF-ul complet al articolului.

Calculul impozitului va fi finalizat în timpul plății.

Referințe

Ivanova, P., Milne, S. și Byrne MO, identificarea și cuantificarea glicerofosfolipidelor prin spectrometrie de masă electrospray, Metode Enzymol., 2007, vol. 432, pp. 21–57.

Bischoff, G. și Zhdanov, R.I. Lipidomica - lipidele participă la complexitatea genomului uman, Chem. Nu. Tehnologie. 2002, vol. 74, nr. 5, p. 714.

Lagarde, M., Geloen, A., Record, M., Vance, D. și Spenner, F., Lipidomica apare, Biochimie. Biofizi. Acta, 2003, vol. 1634, p. 61.

Wenk, MR, Câmpul emergent al lipidomicii, Natura Rev., 2005, vol. 4, pp. 594–610.

Zhdanov, R.I., Salafutdinov, I.I., Arslan, A. și Ibragimova, M.Ya., nou marker al profilului FAME al Pseudomonas aurantiaca lipide totale, Rapoartele Biochem. Biofizi., 2012, vol. 445, nr. 1, pp. 183–186.

Tarasov, DS, Ibragimova, M.Ya., Izotova, ED, Akberova, NI și Zhdanov, R.I., Dinamica moleculară și energia liberă de legare a acidului oleic la ADN în soluții apoase, Rapoartele Biochem. Biofizi., 2012, vol. 446, nr. 2, pp. 223–228.

Zhdanov, RI, Krylov, AS, Zarubina, TV, Bishoff, G. și Ibragimova, M.Y., Complexare între ADN și cardiolipină în funcție de spectrofotometrie și date de dicroism circular, Rapoartele Biochem. Biofizi., 2013, vol. 453, nr. 3, pp. 290–294.

Carvalho, M., Sampaio, J.L., Palm, W., Brankatschk, M., Eaton, S. și Shevchenko, A., Efectele dietei și dezvoltării asupra Drosophila lipidom, J. Mol. Syst. Biol., 2012, vol. 8, nr. 1, pp. 600-605.

Struchkov, VA, Strazhevskaya, NB și Zhdanov, RI, lipide naturale specifice legate de ADN în era postgenomului. Concepția lipidică a organizării cromatinei, Bioelectrochimie., 2002, vol. 56, pp. 195–198.

Struchkov, VA, Strazhevskaya, NB și Zhdanov, RI, lipide legate de ADN ale celulelor normale și tumorale: retrospectivă și perspective pentru genomica funcțională și codul lipid-ADN, Bioelectrochimie., 2002, vol. 58, pp. 23–31.

Albi, E. și Viola Magni, M.P., Rolul lipidelor intranucleare, Biol. Celulă., 2004, vol. 96, nr. 8, pp. 657–667.

Hannun, Y.A. și Obeid, L.M., Principiile de semnalizare a lipidelor bioactive: lecții din sfingolipide, Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 2008, vol. 9, nr. 2, pp. 139-150.

Jump, D.B., Reglarea acidului gras al transcrierii genelor, Crit. Rev. Clin. Laborator. Știință., 2004, vol. 41, nr. 1, pp. 41–78.

Zhdanov, R.I., Strazhevskaya, N.B., Jdanov, A.R., și Bischoff, G., Un studiu de rezonanță spectroscopică și de suprafață plasmonică a complexelor de acid oleic/ADN, J. Biomol. Str. Dyn., 2002, vol. 20, nr. 2, pp. 231–241.

Zhdanov, R.I., Bishoff, G. și Ibragimova, M.Y., Despre asocierea polinucleotidelor ADN cu cardiolipina, Uch. Zap. Kazan. Univ. Ser. Nat. Știință., 2012, vol. 154, nr. 4, pp. 164–174.

Zhdanov, R.I., Struchkov, V.A., Dyabina, O.V. și Strazhevskaya, N.B., Cardiolipină legată de cromatină: fosfolipidul prolifaretiei, Citobios, 2001, vol. 106, pp. 55-61.

Zhdanov, R.I., Shmyrina, A.S., Zarubina, T.V., Kraus, A. și Lorenz, W., Profilurile acizilor grași ai lipidelor legate de ADN și ale lipidelor cu celule întregi ale Pseudomonas aurantiaca diferă drastic, Rapoartele Biochem. Biofizi., 2006, vol. 410, nr. 4, pp. 292–296.

Zhdanov, R.I., Shmyrina, A.S., Mulyukin, A.L., El’Registan, G.I., Zarubina, T.V., Kraus, A., Haupt, N. și Lorenz, W., Fracția lipidică strâns legată de ADN-ul genomic este determinată în procariote, Rapoartele Biochem. Biofizi., 2006, vol. 410, nr. 6, pp. 320–323.

Zhdanov, R., Shmyrina, A., Zarubina, T., Mulyukin, A., El-Registan, G., Haupt, N., Kraus, A. și Lorenz, W., Nature of P. aurantiaca Lipide legate de ADN, FEMS Microbiol. Lett. 2006, vol. 265, pp. 151–158.

Zhdanov, R.I. Kurbanov, R.A. și Ibragimova, M.Y., brevet RF nr. RU 2506314, 2013.

Struchkov, VA și Strazhevskaya, N.B., lipide legate de ADN: compoziție și funcție posibilă, Biochimie, 1993, vol. 58, nr. 8, pp. 1154–1175.

Shepelev, AP, Shestopalov, AV, Ryndich, AA, Staviskii, IM și Yagovkina, VV, lipide legate de ADN de termorezistente și termolabile Shigella sonnei tulpini, Taur. Exp. Biol. Med., 1995, vol. 120, nr. 2, pp. 332–333.

Mulyukin, A.L., Vakhrushev, M.A., Strazhevskaya, N.B., Shmyrina, A.S., Zhdanov, R.I., Suzina, N.E., Duda, V.I. și El’-Registan, G.I. Pseudomonas nas aurantiaca ADN și asupra inducerii disocierii fenotipice, Microbiologie (Moscova). 2005, vol. 74, nr. 2, pp. 128–135.

Strazhevskaya, N.B., Mulyukin, A.L., Shmyrina, A.S., Kraus, A., Lorenz, V., Zhdanov, R.I. și El’Registan, G.I., Caracteristici ale Pseudomonas aurantiaca Complexe supramoleculare ADN în diferite stadii de dezvoltare, Microbiologie (Moscova), 2009, vol. 78, nr. 1, pp. 48-55.

Zhdanov, R.I. și Ibragimova, M.Y., nou nivel informațional la ADN genomic: lipide legate în mod specific de ADN, Genetica și chimia care împărtășesc un limbaj de descoperire: Seria Simpozion de celule, Boston, 2013, p. 29.

Moder, M., Braun, P., Lange, F., Schrader, S. și Lorenz, W., Determinarea compușilor perturbatori endocrini și a medicamentelor acide în apă prin cuplarea derivatizării, cromatografiei în gaz și a spectrometriei de masă cu ionizare chimică negativă, Sol curat, aer, apă, 2007, vol. 35, nr. 5, pp. 444–451.

Abb, M., Heinrich, T., Sorkau, E. și Lorenz, W., Ftalați în praful casei, Mediu Int., 2009, vol. 35, nr. 6, pp. 965–970.

Ruiz N., Kahne D. și Silhavy T.J., Progrese în înțelegerea biogenezei bacteriene a membranei externe, Natura Rev. Microbiol. 2006, vol. 4, pp. 57-66.

D’yachkov, E.P., Ibragimova, M.Y., D’yachkov, P.N. și Zhdanov, R.I., Investigația interacțiunii ADN cu acizii grași prin andocare moleculară, Uch. Zap. Kazan. Univ. Ser. Nat. Știință., 2011, vol. 153, nr. 1, pp. 86-96.

Fuchs, B., Suess, R. și Schuller, Ju., O actualizare a spectrometriei de masă MALDI-TOF în cercetarea lipidelor, Progr. Lipid Res., 2010, vol. 49, pp. 450–475.