Divulgarea autorului: nu există relații de dezvăluit.

influența

David J. Hunter, Influența polimorfismului genetic, Jurnalul de nutriție, volumul 136, numărul 10, octombrie 2006, paginile 2711S - 2713S, https://doi.org/10.1093/jn/136.10.2711S

Introducere

Finalizarea proiectului genomului uman ne-a oferit o secvență canonică a genomului uman. Eforturile ulterioare, cum ar fi consorțiul SNP și proiectul internațional HapMap, au definit spectrul variației moștenite comune în secvența ADN. Proiecte de resecvențiere a genelor direcționate, cum ar fi NIEHS Environmental Genome Project, au furnizat documentație cuprinzătoare despre polimorfisme în unele gene candidate cheie relevante pentru metabolismul nutrienților. Abia începem să înțelegem cum aceste noi informații despre variația genetică umană pot ajuta în complexa sarcină de a dezlega ce componente ale dietei cauzează sau protejează împotriva unor tipuri de cancer specifice (1, 2).

Constatări de bază

Informațiile despre interacțiunea dintre consumul de alimente și nutrienți și polimorfismele moștenite pot fi utile în mai multe moduri și pot servi la 1) definirea subpopulațiilor susceptibile, consolidând astfel asociațiile dietetice; 2) ajută la stabilirea cauzalității asociațiilor alimentare și nutrienți în studiile de epidemiologie; 3) ajută la distingerea componentelor cauzale ale amestecurilor dietetice complexe; și 4) oferă în cele din urmă baza testelor de screening bazate pe gene. Acest lucru ar putea ajuta la furnizarea de strategii individuale de prevenire bazate pe nutriție adulților.

Dacă 1 sau un număr mic din aceste variante prezice riscul unui cancer specific, atunci stabilirea acestui risc ar trebui să fie fezabilă, iar întrebarea se referă apoi la faptul dacă riscul este modificat de dietă și/sau de alți factori „de mediu”. Prin genotiparea cazurilor și a controalelor în cazurile de control tipice sau studii epidemiologice prospective, poate fi posibil să se stabilească ce membri ai acestor studii sunt cu adevărat sensibili și care nu. Dacă anumiți factori dietetici cresc riscul numai la indivizii sensibili, atunci studierea acestora într-un amestec de persoane sensibile și nesusceptibile va atenua riscul de cancer observat pentru acești factori. Puterea asocierii va fi mai puternică dacă analiza poate fi limitată la cei care sunt susceptibili, iar asociațiile mai puternice sunt mai susceptibile să se reproducă și să satisfacă criteriile cauzale clasice.

Nevoile de cercetare

Proiecte precum HapMap (10) au însemnat că variația comună a genelor umane este din ce în ce mai bine documentată. Dezvoltările tehnologiei de genotipare fac posibilă constatarea a mii, chiar sute de mii, de variante într-o singură probă de ADN. Distingerea variației nefuncționale de funcțională și variația funcțională care este relevantă pentru aportul nutrițional de variația funcțională relevantă pentru alte expuneri este o nevoie majoră. Abilitatea de a reduce numărul foarte mare de variante genetice la cele care au relevanță funcțională ar reduce substanțial problema comparațiilor multiple asociate examinării simultane a tuturor variantelor.

O altă nevoie substanțială este dezvoltarea de baze de date pentru a capta cantitatea uriașă de informații care este generată zilnic și care va crește aproape exponențial în următorii ani. Doar o parte din aceste informații ar putea fi publicate în mod rezonabil în lucrări de cercetare convenționale. Fenomenul părtinirii publicării, tendința autorilor de a depune, a recenzorilor de a favoriza și a editorilor de a accepta descoperiri „pozitive”, înseamnă că literatura publicată devine din ce în ce mai părtinitoare în timp, iar studiile relevante, adesea mai mari și superioare „nule” nu sunt puse la dispoziție pentru recenzii de literatură sau meta-analize. Captarea datelor nepublicate într-o formă accesibilă va fi importantă pentru evaluarea realistă a interacțiunilor dietă-genă, dar este o sarcină formidabilă, în special în cercetarea cancerului, unde sunt implicate atâtea tipuri diferite de tumori. Informațiile din diferite studii nu sunt întotdeauna în formate compatibile. Diferite variante pot fi genotipate în aceeași genă de grupuri diferite, inhibând comparațiile rezultatelor. Formarea rețelelor și consorțiilor poate fi utilă în acest sens (11), întrucât protocoalele comune, formatele de date, analizele de date și rezultatele tabulare sporesc în mod substanțial capacitatea de arhivare și interpretare a acestor cantități mari de date.

În concluzie, noile cunoștințe despre diferențele între persoane în răspunsul la dietă ar trebui să ajute la dezlegarea relației complexe a dietei cu riscul de cancer. Este posibil ca, pe viitor, sfaturile dietetice să poată fi adaptate la o susceptibilitate sau rezistență moștenită specifică la anumite tipuri de cancer. Multe date vor trebui generate, partajate și analizate înainte ca această promisiune de „prevenire personalizată” să fie bazată pe dovezi. Între timp, însă, există mai multe modalități prin care stabilirea unor interacțiuni robuste între dietă și genă în riscul de cancer va spori dovezile asocierii unor alimente individuale sau a componentelor acestor alimente, cu riscul de cancer. Aceste evoluții ar trebui să ne îmbunătățească capacitatea de a face declarații mai sigure cu privire la rolul dietei în prevenirea cancerului.