Sinteza glicanului de suprafață celulară în interacțiunile gazdă-agent patogen și în comunicațiile celulă-celulă.

cercetare

Modificarea căilor biosintetice ale peretelui celular al plantelor pentru a permite producția rentabilă de biocombustibili din biomasa plantelor.

Programele actuale de cercetare din laboratorul Bar-Peled sunt:

Rolul glicanilor de suprafață celulară în timpul ciclului de viață al Rhizobium. Studiem evenimentele moleculare care declanșează această bacterie din sol liberă pentru a-și modifica suprafața celulară glican și compoziția glicolipidelor ca răspuns la schimbările din mediul său.

Mecanismele moleculare care permit Bacillus cereus pentru a forma spori care aderă la diverse suprafețe. Această bacterie comună a solului este un agent de otrăvire alimentară dificil de controlat.

Relația dintre sinteza glicanului de la suprafața celulei și interacțiunile dintre ciuperci și gazdele lor vegetale și animale. Studiem modul în care ciupercile aderă și pătrund în celulele gazdă și modul în care acest lucru este legat de bolile cauzate de ciuperci.

Genele și enzimele implicate în sinteza glicanilor peretelui celular al plantelor. Studiem modul în care este reglată sinteza glicanului și modul în care acești glicani se formează în Golgi și apoi sunt transportați la membrana plasmatică unde sunt asamblați într-un perete funcțional. Înțelegerea unor astfel de procese la nivel molecular va permite dezvoltarea culturilor bioenergetice care pot fi convertite în mod rentabil în combustibili lichizi.

Articole de jurnal
Capitolele de carte sunt listate în partea de jos a acestei pagini.

J.D. Willis, J.A. Smith, M. Mazarei, J.Y. Zhang, G.B. Turner, S.R. Decker, R.W. Sykes, C.R. Poovaiah, H.L. Baxter, D.G.J. Mann, M.F. Davis, M.K. Udvardi, M.J. Pena, J. Backe, M. Bar-Peled, C.N. Stewart Jr . 2016. Reglarea descendentă a unei gene UDP-arabinomutază în Switchgrass (Panicum virgatum L.) are ca rezultat lignina peretelui celular incrasat, reducând în același timp arabinoza-glicanii. Frontiers Plant Sci. 7: 1-18. PMID: 27833622

J Smith, Y Yang, S Levy, OO Adelusi, MG Hahn, MA O'Neill, M Bar-Peled. 2016. Caracterizarea funcțională a sintazelor UDP-Apioză din Briofite și alge verzi oferă o perspectivă asupra apariției glicanilor care conțin apioză în timpul evoluției plantelor. J. Biol. Chem. 291: 21434-21447. PMID: 27551039

V. Martinez, M. Ingwers, K.J. Smith, J. Glushka, T. Yang, M. Bar-Peled. 2012. Biosinteza UDP-4-ceto-6-deoxiglucozei și UDP-ramnozei în ciupercile patogene Magnaporthe grisea și Botryotinia fuckeliana . J. Biol. Chem. 287: 879-892. PMID: 22102281

B. Broach, X.-X. Gu, M. Bar-Peled. 2012. Biosinteza acidului UDP-glucuronic și a acidului UDP-galacturonic în Bacillus cereus subsp. citotoxică NVH 391-98. FEBS J. 279: 100-112. PMID: 22023070

T. Yang, Y. Bar-Peled, J.A. Smith, J. Glushka, M. Bar-Peled. 2012. Formarea în microbi a zaharurilor nucleotidice în E. coli proiectat . Biochimie anală 421: 691-698. PMID: 22244806

A. Nag, T. Karpinets, C.H. Chang, M. Bar-Peled. 2012. Îmbunătățirea unei baze de date Pathway-Genome (PGDB) pentru a captura localizarea subcelulară: căile biosintetice nucleogid-zahăr ale Populus trichocarpa . J. Biol. Curarea bazelor de date bas013. Print 2012: -. PMID: 22465851

M. Bar-Peled, B.R. Urbanowica, M. ONeill. 2012. Sinteza și originea polizaharidei pectice ramnogalacturonan ll - perspective din formarea și diversitatea zahărului nucleotidic. Știința plantelor frontale 3: 92-. PMID: 22639675

X.-X. Gu, L.G. Lee, M. Bar-Peled. 2011. Biosinteza UDP-xilozei și UDP-arabinozei în Sinorhizobium meliloti 1021: prima caracterizare a unei UDP-xiloză sintază bacteriană și UDP-xiloză-4-epimerază. Microbiologie 157: 260-269. PMID: 20847005

M. Bar-Peled, M.A. ONeill. 2011. Formarea, interconversia și recuperarea zahărului din nucleotide vegetale prin reciclarea zahărului. Annu. Rev. Biol de plante. 62: 127-155. PMID: 21370975

Y. Yin, J. Huang, X. Gu, M. Bar-Peled, Y. Xu. 2011. Evoluția enzimelor de interconversie nucleotidă-zahăr din plante. Plus unu 6: e27995-. PMID: 22125650

X.-X. Gu, J. Glushka, Y. Yin, Y. Xu, T. Denny, J.A. Smith, Y. Jiang, M. Bar-Peled. 2010. Identificarea unei UDP-4-ceto-pentoză/UDP-xiloză sintază bifuncțională în bacteria patogenă a plantei, str. Ralstonia solanacearium. GMI1000: un membru distinct al familiei 4,6-dehidratază și decarboxilază. J. Biol. Chem. 285: 9030-9040. PMID: 20118241

T. Yang, M. Bar-Peled. 2010. Identificarea unei noi pirofosforilază UDP-zahăr cu o specificitate largă a substratului în Trypanosoma cruzi. Biochimie. . 429: 533-543. PMID: 20482518

X. Gu, J. Glushka, S.G. Lee, M. Bar-Peled. 2010. Biosinteza unui nou UDP-zahăr, UDP-2-acetamido-2deoxixiloză, în patogenul uman Bacillus cereus subspecie citotoxi NVH 391-98. J. Biol. Chem. 285: 24825-24833. PMID: 20529859

T. Yang, M. Echols, A. Martin, M. Bar-Peled. 2010. Identificarea și caracterizarea unei N-acetilglucozamină-1-P uridililtransferază strictă și promiscuă în Arabidopsis . Biochimie. . 430: 275-284. PMID: 20557289

Y. Jiang, T. McKinnon, J. Varatharajan, J. Glushka, J.H. Prestegard, A.T. Somborger, H.B. Schuttler, M. Bar-Peled. 2010. RMN rezolvată în timp: extragerea topologiei rețelelor enzimatice complexe. Biofii. . 99: 2318-2326. PMID: 20923667

T. Yang, L. Bar-Peled, L. Gebhart, S.G. Lee, M. Bar-Peled. 2009. Identificarea acidului galacturonic-1-fosfat kinază, un nou membru al superfamiliei GHMP kinazei în plante și compararea cu galactoza-1-fosfat kinază. J. Biol. Chem. 284: 21526-21535. PMID: 19509290

P. Guyett, J. Glushka, X.-X. Gu, M. Bar-Peled. 2009. Monitorizarea RMN în timp real a produselor intermediare și labile ale enzimei bifuncționale UDP-apioză/UDP-xiloză sintază. Carbohidrati. Rez. 344: 1072-1078. PMID: 19375693

X. Gu, C.J. Salarii, K.E. Davis, P.J./guyett, M. Bar-Peled. 2009. Caracterizarea enzimatică și compararea diferitelor izoforme UDP-GlcA-4-epimerază poaceae. Euro. J. Biochem. 146: 527-534. PMID: 19564155

X. Gu, C.J. Salarii, K.E. Davis, P.J./guyett, M. Bar-Peled. 2009. Caracterizarea enzimatică și compararea diferitelor izoforme UDP-GlcA-4-epimerază poaceae. Euro. J. Biochem. 146: 527-534. PMID: 19564155

S. Pattathil, A. Harper, M. Bar-Peled. 2005. Biosinteza UDP-xilozei: caracterizarea unui UXS2 legat de membrană . Plantă 221: 538-548. PMID: 15655675

A. Frydman, O. Weisshaus, D.V. Huhman, L.W. Sumner, M. Bar-Peled, E. Lewinsohn, R. Fuhr, J. Gressel, Y. Eyal. 2005. Ingineria metabolică a celulelor vegetale pentru biotransformarea hesperedinei în neohesperidină, un substrat pentru producțiile de îndulcitor cu conținut scăzut de calorii și potențiator de aromă NHDC. J. Agric. Food Chem. 53: 9708-9712. PMID: 16332119

G. Watt, C. Leoff, A.D. Harper, M. Bar-Peled. 2004. O 3,5-epimerază/4-ceto reductază bifuncțională pentru sinteza nucleotidelor-difosfo-ramnozei în Arabidopsis . Fiziol vegetal. 134: 1337-1346. PMID: 15030319

A. Frydman, O. Weisshaus, M. Bar-Peled, D. Huhman, L.W. Sumner, F.R. Marin, E. Lewinsohn, R. Fluhr, J. Gressel, Y. Eyal. 2004. Arome amare de citrice: izolarea și caracterizarea funcțională a genei Cm1,2RhaT care codifică o 1,2 ramnosiltransferază, o enzimă cheie în biosinteza flavonoidelor amare ale citricelor. Planta J. 40: 88-100. PMID: 15361143

M. Bar-Peled, C.L. Griffith, J.J. Ory, T.L. Doering. 2004. Biosinteza UDP-GlcA, un metabolit cheie pentru sinteza capsulară a polizaharidelor în ciuperca patogenă Cryptococcus neoformans . Biochimie. . 381: 131-136. PMID: 15030319

X.-X. Gu, M. Bar-Peled. 2004. Biosinteza acidului UDP-galacturonic la plante. Clonarea funcțională și caracterizarea acidului Arabidopsis UDP-D-glucuronic 4-epimerază. Fiziol vegetal. 136: 4256-4264. PMID: 15563616

A. Harper, M. Bar-Peled. 2002. Biosinteza UDP-xilozei: Clonarea și caracterizarea unei noi familii de gene Arabidopsis, UXS, care codifică izoformele UDP-GlcA decarboxilază solubile și supuse membrane. Fiziol vegetal. 130: 2188-2198. PMID: 12481102