Un rezumat zilnic de lucrări științifice despre microbiomi, de către echipa MD. Fondată de Elisabeth Taurus, consultant în microbiom și integritate științifică. Twitter: @microbiomdigest
Microbiom reproductiv uman
Microbiom animal
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de apă și extremofil
Microbiom mediu/bani construit
Metabolomica
Eșantionare oportunistă de Roadkill ca punct de intrare pentru accesarea produselor naturale asamblate de bacterii asociate cu microbiomi de mamifere non-antropoidale - Jeremy L. Motley - Journal of Natural Products
Tehnici
Notă: contaminarea umană în probele de fecale este de obicei scăzută (de exemplu, comparată cu probele orale sau vaginale; nu este o problemă în opinia mea: o metodologie îmbunătățită pentru a depăși problemele cheie în extracția ADN-ului metagenomic fecal uman - Jitendra Kumar - Genomică, Proteomică și Bioinformatică
Mai multă microbiologie
Microbii în știri
Această lucrare nu este încă disponibilă online la Molecular Biology and Evolution, dar există deja unii presa despre asta:
Un copac cuprinzător al vieții procariote - Science Daily
Noi perspective din cel mai cuprinzător copac al vieții procariote asamblate până în prezent - Phys.org
Video: Germeni buni; Germeni răi. Microbi în bucătărie, 14 gospodării, 500 de tampoane - Universitatea din Oxford - YouTube
Isteria bacteriilor
Notă: Sponsorizat de o companie specializată în controlul dăunătorilor și produse de igienă. Bacteriile din școala primară îi lasă pe profesori cu risc de boală - TES
Microbiom uman multisite (al cadavrelor)
Microbiom oral uman
Microbiomul reproducerii și tractului urinar uman
Citokinele proinflamatorii ca regulatori ai microbiotei vaginale - E. A. Kremleva - Buletin de biologie și medicină experimentală
Microbiomul intestinal uman
Recenzie: Microbiota intestinală și autismul: concepte și constatări cheie - Helen T. Din - Journal of Autism and Developmental Disorders
Recenzie: Microbiota intestinală ca țintă terapeutică alternativă pentru epilepsie - Jiaying Wu - Jurnalul canadian de boli infecțioase și microbiologie medicală
Recenzie: Sindromul intestinului iritabil: o tulburare legată de microbiota intestinală? - Yogesh Bhattarai - American Journal of Physiology - Gastrointestinal and Liver Physiology
Recenzie: Microbiom, metaboliți și imunitatea gazdei - Maayan Levy - Opinie curentă în microbiologie
Modele animale și in vitro
Microbiom animal
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de apă și extremofil
Viruși și fagi
Metabolomica
Metagenomică și bioinformatică
Tehnici
Microbii în știri
Fericit Ziua Recunoștinței! Inboxul meu era plin de noi hârtii interesante, așa că iată un rezumat înainte de a începe să gătesc.
Microbiota și epigenetica, bacteriile prădătoare pentru a controla infecția, bacteriile controlează nivelul apei din frunze, compușii volatili microbieni afectează creșterea plantelor, viromul nevertebrat și produsele naturale ca mediatori ai bolii.
Microbiom respirator uman
Dovezi ale disbiozei microbiotei în rinosinuzita cronică - Michael Hoggard - International Journal of Allergy & Rhinology
Microbiomul intestinal uman
Noi opțiuni de tratament pentru sindromul intestinului iritabil cu diaree predominantă - Weber, H. Christian - Opinie actuală în endocrinologie, diabet și obezitate
Modele animale
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de apă și extremofil
Viruși și fagi
Metabolomica
* Recenzie: Produse naturale ca mediatori ai bolii - Neha Garg - Rapoarte despre produse naturale
Tehnici
Aspecte esențiale ale cercetării: Culturomică: iluminarea substanței întunecate microbiene - Iain Dickson - Nature Reviews Gastroenterologie și hepatologie
Microbii în știri
Alegerile non-microbiologice ale lui Bull
„Din fericire, când îți vei analiza propriul microbiom de către uBiome, vei fi ușurat să știi că nu vom trimite un tip într-un elicopter cu pistol tranchilizant. Tot ce trebuie să faceți este să tamponați ușor o bucată de hârtie igienică uzată. ”
Microbiomul intestinal uman
Microbiologia siturilor aproape sterile
Experimente pe animale
Evaluarea microbiotei fecale la vițeii de vită - J.S. Weese - Journal of Veterinary Internal Medicine
Microbiom animal
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de apă și extremofil
Microbii în știri
Mirobiom vaginal în PPROM, Prevotella copri și artrita reumatoidă, șoareci transplantați cu scaun de la oameni slabi sau obezi, arhee într-un iaz.
Sarcina și viața timpurie
Microbiom oral uman
Experimente pe animale
Microbiom animal
Analiza comunitară bazată pe secvențierea Illumina a bacteriilor asociate cu diferiți briofiți colectați din Tibet, China - Jing Yan Tang - BMC Microbiology
https://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12866-016-0892-3
Rețele care descriu co-aparițiile la scară fină ale ciupercilor în orizonturile solului - Hirokazu Toju - PLOS ONE
Microbiom de apă și extremofil
Microbiologia poluării
Influența plantației asupra comunității microbiene în betonul poros care tratează apa de suprafață poluată - Yan Long - Biodeteriorare internațională și biodegradare
Microbiologia alimentară
Studiul diversității bacteriene a alimentelor: PCR-DGGE versus LH-PCR - Cristiana Garofalo - International Journal of Food Microbiology
Viruși și fagi
Mai multă microbiologie
Descoperirea de noi medicamente și ținte - Andrea Du Toit - Nature Reviews Microbiology
Microbiota sub presiune - Andrea Aguilar - Nature Reviews Nephrology
Microbii în știri
‘Bacteria beaters’ câștigă Premiul pentru descoperirea longitudinii - Shan Ross - Scoțianul
Știință, publicare și carieră
O altă tranșă din Bik’s Brain - o colecție minunată de asociații ciudate. Bine ai venit la creierul meu.
De ce este unic microbiomul vaginal uman, scleroza multiplă, microbii intestinali lipsiți de fibre care mănâncă mucus, structura verticală a filosperei, microbiom de peșteră, rezistom.
Sarcina și viața timpurie
Microbiom vaginal uman
Microbiomul intestinal uman
Experimente pe animale și in vitro
Microbiom animal
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom extremofil
Microbiologia alimentară
Metabolomica
Rezistent
Microbii în știri
"Electricitate? Așa a trecut. Designerul olandez Teresa van Dongen a îndrăznit să combine biologia cu tehnologia creând o lampă fără electricitate - Ambio - care funcționează pe bacterii caracatiței. „
Lampa Ambio este umplută cu bacterii bioluminescente vii. Sursa: PSFK.com
„Anywhen este o lucrare captivantă a artistului de avangardă francez Philippe Parreno. (…) Prezintă un amestec în continuă schimbare de sunet, lumină și umbră, mărit de baloane în formă de pește, o gamă transformatoare de difuzoare suspendate și un cinematograf care apare aparent la întâmplare. Cu excepția cazului, nu este întâmplător. Elementele individuale ale Anywhen sunt în capriciul bacteriilor. ”
„Vreau să transform muzeul într-un fel similar de instrument, un hibrid ciudat realizat din lumină și sunet înregistrat și bacterii și panouri acustice, cu secvențe și motive care se repetă și se retrag”, a spus el. „Dacă nu doriți să petreceți opt ore acolo, cu siguranță vă va fi dor de ceva. Dar asta face parte din ea, nu? Mereu îți este dor de ceva în viață ”.
„Anywhen” de Philippe Pareno, o expoziție controlată de bacterii. Sursa: Engadget.com.
„Simon Park este un om de știință care vrea să ne învețe despre microbiom prin arta sa. Printre lucrările sale se numără un autoportret, dantelă și vitralii, toate acestea fiind produse din bacterii! (...) Prin arta sa, el își propune să ne atragă atenția asupra lor și să le facă mai familiare. (Apoteoza acestuia din urmă este autoportretul său din propria sa floră microbiană!)
Vitralii bacteriene de Simon Park. Sursa: Labiotech.eu.
„Cum pot oamenii de știință din biodiversitatea solului să își împărtășească cunoștințele cu publicul? Arta este răspunsul dat de „Viziunile subterane ale vieții: solul face artă”, un proiect finanțat de Leverhulme Trust din Marea Britanie. Acest proiect sprijină un artist în reședință, Ed Reynolds, care lucrează cu dr. Tancredi Caruso, ecolog sol la Școala de Științe Biologice, Universitatea Queen’s Belfast. "
Opera de artă originală de Ed Reynolds. Sursa: Global Soil Biodiversity.com
„Cine știe dacă pot schimba vieți? Știu că pot schimba modul în care studenții mei privesc lumea, folosind „ochelari de culoare microbiană”. De asemenea, cred că arta se poate intersecta cu știința, adesea în moduri care îmbunătățesc învățarea. În acest semestru, am avut micronauții mei Biology 350 să-l încerce în două moduri diferite, cu (sperăm) ceva succes. În primul rând, Vexed Muddler și cu mine am pregătit o competiție #MicrobialArt. ”
Arta lui Josh a câștigat Premiul I: presupuneri neloiale și inexacte despre lumea microbiană.
„A fost un demen de #MicrobialMorning, dar mai aveau de urmat. Așa este: era timpul pentru #LuxAcademyAwards! La începutul acestui semestru, am făcut studenții să creeze „artă microbiană” prin „pictura” cu bacterii luminoase (Photobacterium leignothi) pe cutii Petri. Am vrut apoi ca oamenii de pe Internet să voteze favoritele lor și să distribuie încă mai mult #MicrobialSwag către #MicrobialArtists! ”
Molly a creat # LuxArt2016 câștigătorul locului 4.
„Bacteriile sunt mai mult decât elementele de bază ale microorganismelor din ultima expoziție colectivă de artă a slavilor și tătarilor la Galeria Tanya Bonakdar. Intitulată Afteur Pasteur, un omagiu adus microbiologului care a descoperit fermentarea și pasteurizarea microbiană, expoziția folosește referințe la bacterii și microbi ca lentile improbabile pentru a examina idei culturale și istorice mai mari. (...) O „bară de bacterii” complet funcțională servește băutura de iaurt ayran (îmi pare rău, nu există kombucha aici) permițând vizitatorilor să ingereze o formă constitutivă de viață în timp ce parcurg lucrările rămase. ”
Bar Ayran, Slavi și Tătari, 2016. Sursa: The Creators Project.
Metformin și diabet, șopârle, filosferă braziliană, pământ întunecat amazonian, poluarea aerului în China, microbiomi de înghețată și canabis.
Microbiom general
Microbiologia pielii și plăgilor umane
Microbiomul intestinal uman
Microbii din sânge, urină și țesuturi
Experimente pe animale
Microbiom animal
În ficat, nu în fecale: Evaluarea metagenomică a bacteriilor din molii - Katja A. Koskela - Bolile vectoriale și zoonotice
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de apă și poluare
Microbiologia aerului
Microbiologia alimentară și a canabisului
Bioinformatică
Mai multă microbiologie
Microbii în știri
Știință, publicare și carieră
Agenți patogeni în artrita reumatoidă, Stafilococ în lucrătorii de porc, agenți patogeni în guano de lilieci, determinanți ai colonizării gazdei, microbi pe tastaturile ATM din New York.
Microbiom oral uman
Microbiom respirator uman
Microbiomul intestinal uman
Recenzie: Dieta, microorganismele și metaboliții lor și cancerul de colon - Stephen J. D. O'Keefe - Nature Reviews Gastroenterologie și hepatologie
Experimente pe animale
Microbiom animal
Microbiom de plante, rădăcini și sol
Microbiom de mediu construit
Microbiom alimentar
Deducerea rolului microorganismelor în fermentațiile de kefir din apă - Abigail Martínez-Torre - International Journal of Food Science & Technology
Microbii în știri
Academia australiană de științe anunță premii onorifici din 2017, inclusiv profesorul de boli infecțioase Kathryn Elizabeth Holt
Rolul microbiomei în medicina de precizie, cu Jun Sun și Jack Gilbert - Kristen Thometz - WTTW