Detalii de contact: E-mail: [email protected];

microbiome

Tel: +353 21 4903997
Site-ul web: http://eldermet.ucc.ie

Pentru o listă completă de publicații vă rugăm să consultați: http://www.researcherid.com/rid/G-1593-2012

Profil de carieră:

Detalii științifice:

Folosesc genomică comparativă și funcțională pentru a studia interacțiunea gazdă-microb, prin programe pe lactobacili și sistemul imunitar înnăscut (TLRs; liganzi); lactobacilul ca agenți patogeni orali și oportunisti (NYU și WT Sanger Center); motilitatea și asamblarea flagelului în lactobacili, enterococi și H. pylori. Colaborez și cu Rowett Center/Univ. Aberdeen în stabilirea sistemelor genetice pentru comensalele intestinale anaerobe.

M-am extins de la modele reducționiste de interacțiune gazdă-microb la analize metagenomice intestinale, care generează ipoteze care să folosească studii reducționiste mai inteligente. În 2007, am început proiectul ELDERMET (eldermet.ucc.ie) care investighează interacțiunile de sănătate dietă-microbiotă la 500 de subiecți> 65 de ani. În același timp, am folosit platforma noastră de microbiota pentru a determina modificările microbiotei într-o cohortă suedeză de pacienți cu sindrom de colon iritabil. Am sugerat provocator [22180058] stratificarea subiecților IBS într-o microbiotă normală, dar anxietate și depresie mai ridicate sau microbiota modificată, explicând astfel potențialul de răspuns scăzut al terapiei și rata ridicată de răspuns placebo în IBS. Extindem acest lucru la câteva sute de pacienți cu IBS din Cork și suntem pe cale să desfășurăm un studiu deschis de terapie cu antibiotice, stratificat după compoziția microbiotei.

ELDERMET a oferit cu succes informații despre modul în care dieta modulează microbiota la vârstnici și despre modul în care o microbiotă cu diversitate scăzută cauzată de o dietă îngustă se corelează cu fragilitate și scoruri mai mici pentru cunoaștere, inflamație mai mare și sarcopenie mai severă [Pubmed ID 22797518]. Conduc pachetul de lucru privind metagenomica unui Univ. Proiecte UE conduse de Bologna (http://www.nu-age.eu/) în care 1250 de subiecți primesc suplimentarea cu elemente ale unei diete mediteraneene timp de un an. Analiza metagenomului, inflammasomului și metabolomului ne va permite să analizăm cauzalitatea, mecanismele și căile dacă dieta schimbă microbiota și dacă aceasta are impact asupra sănătății. Prin intermediul colegilor locali, naționali și internaționali, sunt implicat și în proiecte care studiază microbiota orală și implicarea potențială a microbiotei intestinale în scleroza multiplă și boala Parkinson. Coloana vertebrală a tuturor acestor proiecte într-un laborator de bioinformatică pur cu 8 membri, dintre care 5 la nivel post-doctoral, două asistente de cercetare și un grup de 6-10 oameni de știință. Dezvoltăm, aplicăm și rafinăm noi soluții pentru provocări bioinformatice în genomica comparativă, evoluția genomului și structura comunității bacteriene.

Interese de cercetare:

Sunt profesor de genomică microbiană la Școala de Microbiologie UCC și investigator principal la APC Microbiome Institute. Rolul meu în APC este de a co-conduce programul Microbiota în Extreme of Life, în special studii asupra persoanelor în vârstă. De asemenea, folosesc modele reducționiste pentru studierea interacțiunilor de sănătate dietă-microbiotă, prin programe pe lactobacili și sistemul imunitar înnăscut (TLR; liganzi); lactobacilul ca agenți patogeni orali și oportunisti (NYU și WT Sanger Center); motilitatea și asamblarea flagelului în lactobacili, enterococi și H. pylori. Colaborez și cu Rowett Center/Univ. Aberdeen în stabilirea sistemelor genetice pentru comensalele intestinale anaerobe.